Questi sofisticati meccanismi di autenticazione a più fattori rappresentano un grande avanzamento per proteggere gli utenti dai rischi ai quali sono invece esposti in caso di utilizzo di semplice password o di autenticazione 2FA via SMS. Tuttavia sono relativamente più difficili da integrare. Le app di autenticazione che generano token software devono essere installate sui dispositivi, con l'app protetta con l'autenticazione biometrica. Inoltre, occorre prima registrare con l'app ogni servizio che si desidera, prima di utilizzarlo. I token hardware, come le chiavi USB, di contro devono invece essere trasportati fisicamente ogni volta che si accede ad un servizio. Insomma, ogni passaggio di sicurezza che viene introdotto influisce comunque sulla comodità dell'utente, questo è inevitabile. La maggior parte delle aziende mira quindi a trovare un equilibrio tra le esigenze di sicurezza e la comodità per i propri utenti e dipendenti. Da questo punto di vista, l'autenticazione 2FA basata su SMS rimane la più semplice e non influisce così tanto sul meccanismo di autenticazione da renderlo scomodo. 

Le aziende che decidono di fornire meccanismi di autenticazione ai propri utenti finali devono provare a garantire processi sufficientemente privi di intoppi, da consentire a un numero maggiore di utenti di abilitarli. Ad esempio è possibile valutare alcuni fattori per ridurre eventuali difficoltà a impiegare questi meccanismi, tenendo di conto la posizione o il tipo di sistema dal quale l'utente vuole accedere. Se non viene registrata alcuna anomali, si può garantire l'accesso con un solo fattore. Qualora invece si riscontrino anomalie si possono richiedere più fattori. Nei fatti questa metodologia garantisce una certa flessibililità nella selezione delle modalità di autenticazione, riducendo l'attrito che queste possono avere sull'utente finale. 

Agli utenti invece consigliamo di rendere più solido il proprio login con l'autenticazione a più fattori, valutando i meccanismi più adatti oltre il mero uso delle password. Anche perchè sono sempre più numerosi i siti che supportano una qualche forma di autenticazione 2FA, quindi è consigliabile, dove si può, abilitarla. Se possibile consigliamo di evitare la 2FA via SMS o chiamata telefonica, preferendo le app token software come Google Authenticator quando possibile. In ogni caso è sempre meglio avere attivata una qualsiasi forma di autenticazione 2FA, anche quella via SMS se non ve ne sono altre disponibili. Aggiungere poi passcode o token biometrici al proprio smartphone garantirà anche la sicurezza del dispositivo utilizzato. I benefici in termini di sicurezza supereranno lungamente i fastidi provocati da questi meccanismi. 

Seqrite supporta l'autenticazione multifattore su una vasta gamma di prodotti e servizi. Dati sensibili e riservato, nella maggior parte dei casi sono protetti con qualche forma di 2FA. Seqrite considera anche alcuni fattori di contesto, come il fuso orario o la posizione come importanti fattori di autenticazione. La soluzione EPS di Seqrite tiene in considerazione e mitiga anche i rischi associati a transazioni fraudolente.